共21章
《夸克文明》从一次偶然交集写起，原本各有生活轨迹的两个人，因为一桩意外重新靠近。几次得失推动人物重新认识彼此，表面的矛盾之外，隐藏已久的动机也被慢慢带出。人物在得失之间不断改变立场，都市情感小说需要的关系拉扯和情节转折，也顺着经历自然生长。矛盾在后段集中爆发，人物关系随之迎来转折，尚未说尽的心事则为故事留下余味。
第一章：末日投影
第二章：诸神与巨炮
第三章：细胞的低语
第四章：癌变的文明
第五章：观察者即病灶
第六章：绝望中的微光——神经脉冲假说
第七章：抉择——从对抗到沟通
第八章：方舟计划——文明的共鸣曲
第九章：短暂的赦免
第十章：痛苦的涟漪
第十一章：肝叶宇宙（技术实现与认知崩塌）
第十二章：天灾即治疗
第十三章：微观与宏观的绝望映照
第十四章：沉寂的惊雷
第十五章：绝望中的微光——神经脉冲假说
第十六章：反向祈祷计划——文明的针炙
第十七章：意念之针
第十八章：震颤的回响
第十九章：兴奋与恐惧并存
第二十章：尘埃的意义
第二十一章：新的回响
